Ante el alarmante aumento de extranjeros que están ingresando a México y para frenar lo que se cree una ola migratoria, las autoridades convierten el examen de historia, requisito nuevo, en un trámite impasable. Seis extranjeros que coinciden en dicho examen lo reprueban pero descubren que Humboldt, el primer naturalizado en la Historia de México, será la clave que les permitirá acceder a una nueva oportunidad. Los seis migrantes deciden juntar fuerzas y arman un grupo de estudio.
Humboldt, México para los mexicanos narra de forma paralela la naturalización del gran naturalista alemán Alexander von Humboldt y la de estos seis extranjeros, cuyas historias están articuladas alrededor de la figura del padre, eje temático fundamental en la cultura mexicana.